日本データベース学会

dbjapanメーリングリストアーカイブ(2005年)

3rd IPSJ/Sigbio meeting in December


各位

情報処理学会バイオ情報学研究会のご案内をお送りいたします。今回は12月22
日(木)に東京大学医科学研究所で開催予定で、14件の多彩な発表が予定され
ております。データベースとも深い関係がある発表ばかりです。ふるってご参加下さい。

植村俊亮

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情報処理学会バイオ情報学研究会
 http://db-www.naist.jp/ipsj-sigbio/
 第3回研究会開催のご案内
(バイオインフォマティクス学会生物情報ネットワーク研究会と共催です)
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日程: 2005年12月22日(木)  
会場: 東京大学医科学研究所講堂
     〒108-8639 東京都港区白金台 4-6-1
http://157.82.98.20/imswww/About/Access-j.html
担当運営委員: 渋谷哲朗,五斗進
tel:0774-38-3271  fax:0774-38-3269

● Sequence & structure analysis(9:20〜10:50)
(1) 機械学習によるタンパク質N-ミリストイル化規則の予測
  岡田 諒,杉井 学,松野浩嗣(山口大),宮野 悟(東大)
(2) Stochastic multiple context-free grammar for RNA structure analysis
  加藤有己,関 浩之(奈良先端大)
(3)蛋白質−化合物複合体の相互作用部位プロファイルを用いた類似相互作用
蛋白質検索方式
  吉野公一(阪大),大川剛直(神戸大)

<休憩 10:50〜11:00>

● Pathway and database(11:00〜12:30)
(4) 化合物構造比較法に基づく酵素反応特有な原子変換パターンの解析
  服部正泰,山田拓司,Min-A Oh,五斗 進,金久 實(京大)
(5) 系統プロファイルを利用した代謝反応ネットワーク中の保存領域抽出手法
  三宅晶子,竹中要一,松田秀雄(阪大)
(6) 神経細胞データベースモデルのインタフェース同定とアノテーション
  大武美保子,高木利久(東大)

<昼食 12:30〜13:30>

● Expression analysis(13:30〜15:30)
(7) 遺伝子発現プロファイルからのオペロン構造予測のための Path 
Consistency Algorithm の改良
  齊藤 秀(インフォコム/東大),油谷幸代,堀本勝久(東大)
(8) グラフィカル連鎖モデルに基づく因果推定法の遺伝子発現プロファイルへの適用
  油谷幸代(東大),齊藤秀(インフォコム/東大),堀本勝久(東大)
(9) Detecting Cell Cycle Regulated genes in S. pombe with Non-metric 
Multidimensional Scaling without sinusoidal fittings
  Yoshihiro Taguchi (中央大.)
(10) State space model approach to analyse cDNA microarray time course 
data of yeast
  山口 類(九大),樋口知之(統計数理研究所)

<休憩 15:30〜15:50>

● Text mining(15:50〜17:50)
(11) 相互作用情報タグつき生命科学論文アブストラクトコーパスの作成
  大田朋子,金進東,建石由佳,辻井潤一(SORST/JST, 東大)
(12) Disease-gene relations extraction using domain dictionaries and 
named entity recognition filtering
  全弘宇(東大),鶴岡慶雅,金進東(SORST/JST, 東大),司馬理恵,長
田直樹,日紫喜光良(産総研),辻井潤一(SORST/JST, 
東大)
(13) PROFESS, a System to Support Extracting Protein Function 
Information from Literature based on the Relevance Feedback from the 
Operator
  Md. Ahaduzzaman Munna (阪大), Takenao Ohkawa (神戸大)
(14) 文書頻度係数の線形時間アルゴリズムの実装と評価
  尾田 晃(豊橋技科大)
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(以上)