日本データベース学会

dbjapanメーリングリストアーカイブ(2006年)

バイオインフォマティクス学会オントロジー研究会


dbjapan の皆様、
京都大学化学研究所の五斗と申します。

直前になってしまいましたが、明日(10月31日)に東京大学医科学研究所で
バイオインフォマティクス学会オントロジー研究会をオープンバイオ研究会
と合同で開催します。バイオ系のデータベース構築に携わっている方々の講
演もあります。参加無料ですので、奮ってご参加下さい。

プログラムを最後に付けますが、詳細は以下の URL をご参照下さい。
http://www.jsbi.org/jsbi_new/kenkyukai/ontology/3rd_news.html

よろしくお願いいたします。

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五斗 進 <goto [at] kuicr.kyoto-u.ac.jp>
  京都大学化学研究所 バイオインフォマティクスセンター
  tel:0774-38-3271  fax:0774-38-3269

 	 
10:00〜10:15 はじめに	 
10:15〜10:45	EzCatDB: A Database of Enzyme Catalytic Mechanisms
http://mbs.cbrc.jp/EzCatDB/
長野希美(産業総合技術研究所生命情報科学研究センター)
10:45〜11:15	eF-site: electrostatic surface of Functional-site
http://ef-site.hgc.jp/
木下賢吾(東京大学医科学研究所)
11:15〜11:45	DBTSS: Database of Transcriptional Start Site
http://dbtss.hgc.jp/
山下理宇(東京大学医科学研究所)
 	 
11:45〜13:00	昼食
 	 
13:00〜13:30	ODB: Operon DataBase
http://odb.kuicr.kyoto-u.ac.jp/
奥田修二郎(京都大学化学研究所)
13:30〜14:00	CellMontage
http://cellmontage.cbrc.jp/
藤渕航(産業総合技術研究所生命情報科学研究センター)
14:00〜14:50	かずさDNA研究所におけるデータベース構築
中村保一(かずさDNA研究所)
 	 
14:50〜15:10	休憩
 	 
15:10〜15:40	ActiveRecord によるバイオデータベースモデリング:UniProtとGO DatabaseとGFFの場合
中尾光輝(かずさDNA研究所・産業総合技術研究所生命情報科学研究センター)
15:40〜16:10	E-Cell 3D:細胞シミュレーションの新しい見方
荒川和晴(慶応義塾大学先端生命科学研究所)
16:10〜16:40	BioFlash.org - Flash (Flex) による初級バイオインフォツールの紹介とオープンバイオ化
坂庭真悟(bioFlash.org)
16:40〜17:10	文献情報使いますか?
山本泰智(東京大学大学院新領域創成科学研究科)
17:10〜17:40	DDBJ Web services (DDBJ-XML)の更なる利用向上への取り組みについて
阿部貴志(国立遺伝学研究所)
 	 
17:40〜18:00  	総合討論